CRISPR是原核生物基因組內,一段短的重復序列,天然存在于細菌和古細菌中。在病毒和細菌的“進(jìn)化斗爭史"過(guò)程中,病毒可以把自身的基因整合到細菌中,進(jìn)一步利用細菌的胞內“工具",幫助自己完成基因的復制過(guò)程;而細菌為了將病毒入侵帶來(lái)的非己基因清除,進(jìn)化出CRISPR-Cas9系統。利用該系統,細菌把病毒基因從自己的基因組上剪切掉。從整個(gè)過(guò)程來(lái)看,CRISPR-Cas9系統是細菌的“免疫系統",是抵抗病毒等外源遺傳物質(zhì)入侵的一種獲得性免疫系統。
CRISPR-Cas9系統包含guide RNA,也被稱(chēng)為single guide RNA,sgRNA,以及有核酸內切酶活性的Cas 9蛋白。
其中sgRNA包含了與目標DNA上特定基因序列互補的一段RNA序列,以及用于識別Cas9的一段序列。Cas9是一種酶,它充當CRISPR系統的“剪刀"。Cas9能夠被程序性地引導到目標DNA上,并在特定的DNA序列位置切割DNA鏈。
在實(shí)驗過(guò)程中,將sgRNA與Cas9蛋白結合,形成一個(gè)復合物。這個(gè)復合物能夠通過(guò)sgRNA的序列精確定位到目標基因的位置,并引導Cas9切割目標DNA。一旦DNA被切割,細胞的自身修復機制會(huì )介入,修復DNA損傷。DNA修復過(guò)程通常涉及兩種主要機制。非同源末端連接(non-homologous end joining,NHEJ)通常導致隨機的插入或刪除DNA片段,從而引起基因突變。同源重組(homology-directed repair,HDR)允許精確地插入新的DNA序列,實(shí)現精確的基因編輯。
CRISPR的成功應用,有諸多關(guān)鍵點(diǎn),其中一項,就是對于實(shí)驗環(huán)境中,核酸污染的控制。在PCR實(shí)驗室中,DNA污染很難清除。即使只有一個(gè)污染的DNA分子被檢測到,也會(huì )使整個(gè)PCR檢測過(guò)程出現誤差。為確保PCR試驗數據準確,預防DNA或RNA交叉污染,PCR實(shí)驗室大多會(huì )常備DNA/RNA污染清除劑。德國MB公司生產(chǎn)的PCR Clean™,可有效地降解大多數表面上(輕質(zhì)金屬或有色金屬除外)的擴增子,質(zhì)?;蚧蚪MDNA和RNA。該產(chǎn)品還能有效地去除DNA酶和RNA酶。使用便捷,可直接噴灑在物體表面。保護實(shí)驗人員,避免接觸DNA污染。非堿性,無(wú)致癌性,成分安全。