支原體qPCR法介紹:
熒光定量PCR法(qPCR):是在常規PCR基礎上,將『針對支原體特異性保守序列的探針』做熒光標記,使PCR擴增后的產(chǎn)物帶有熒光,利用熒光信號的變化和配套軟件,進(jìn)行DNA擴增反應的實(shí)時(shí)監測,簡(jiǎn)稱(chēng)qPCR。
優(yōu)點(diǎn):
①靈敏度高、特異性強。
②時(shí)間短,2-3小時(shí)出結果
③檢測結果可定量
④操作簡(jiǎn)便
缺點(diǎn):
①對于已做支原體滅活處理的樣品,由于支原體DNA仍舊存在其中,PCR結果會(huì )出現假陽(yáng)性。(可用培養法做補充驗證)
②不同廠(chǎng)家生產(chǎn)的試劑盒質(zhì)量差異巨大(由于引物及內在設計不同),需謹慎選擇,盡量在專(zhuān)業(yè)人員推薦指導下使用。
操作步驟
第1步:樣本處理
a.細胞培養上清
b. 生物藥或需遵循藥典的樣本
說(shuō)明:①樣品基質(zhì)可能會(huì )影響檢測的靈敏度。收集和篩選更高的樣品量可提高測定靈敏度。
②細胞培養物樣本含豐富的DNA酶,在低溫下也能降解支原DNA,影響檢測靈敏度。
建議:樣本做DNA抽提處理,實(shí)現最高靈敏度。
推薦:德國MB公司生產(chǎn)的專(zhuān)用支原體DNA提取試劑盒
Venor® Gem Sample Preparation Kit
該DNA抽提試劑盒已經(jīng)過(guò)廣泛驗證。
第2步:試劑制備
a.凍干粉溶解
b. 反應體系制備
b1) 樣品為細胞上清篩查——反應體系制備
b2) 樣品為生物藥——反應體系制備
第3步:?jiǎn)?dòng)熒光定量PCR儀
第4步:結果判別
FAM通道:檢測支原體熒光信號。HEX通道:檢測內控對照熒光信號。
支原體DNA和內控DNA存在信號的競爭性抑制。
支原體DNA越多,FAM通道信號越高,檢測內控對照的HEX通道信號越低。
定量需基于Ct值和DNA標準曲線(xiàn)。
Ct<40為陽(yáng)性結果。Ct≥40為陰性結果