支原體放行檢測,在臨床相關(guān)的項目中發(fā)揮著(zhù)重要作用。常見(jiàn)的一些研究,如干細胞治療項目、免疫細胞治療項目研究、CAR-T項目研究、抗體藥研究、疫苗等領(lǐng)域,以及還有一些重要的細胞培養、細胞典藏項目,都需要對培養的細胞或收獲的產(chǎn)物,進(jìn)行準確度較高的支原體檢測,以保證產(chǎn)物沒(méi)有支原體污染。?
qPCR法是十分常用的支原體檢測方法。藥典中指出,通過(guò)方法學(xué)驗證,即在檢測限、特異性和耐用性等方面達到要求后,才能替代傳統的檢查方法。因此,qPCR實(shí)驗的結果的穩定性與精準度,直接關(guān)系到方法學(xué)驗證是否可信。
除了實(shí)驗操作、所選擇的試劑盒等常見(jiàn)的影響因素,待檢樣品的預處理方法,也會(huì )對qPCR檢測結果造成不同程度的影響。
用于支原體檢測的樣品的成分通常比較復雜,可能存在抑制PCR的物質(zhì),影響qPCR實(shí)驗的結果。在進(jìn)行qPCR檢測之前,需要將樣品中的支原體DNA純化出來(lái),以確保檢測的準確性和靈敏度。
進(jìn)行DNA提取的優(yōu)勢:
1、提高檢測的準確性:DNA提取可以有效地從復雜樣品中分離出支原體的DNA,避免雜質(zhì)對檢測結果的干擾,從而提高檢測的準確性,降低假陽(yáng)性結果的可能性。
2、增加檢測的靈敏度:通過(guò)DNA提取,可以將支原體的DNA濃縮到較高的水平,使其在qPCR中的檢測限度更低,提高了檢測的靈敏度,即能夠檢測到更低濃度的支原體。
3、節省成本:雖然DNA提取可能需要一定的時(shí)間和成本,但它可以避免由于假陽(yáng)性結果而帶來(lái)的額外成本,如錯誤的結果導致方法學(xué)驗證失敗等。
因此,當待檢樣品如果存在以下幾種情況(包括但不限于),需要對樣品進(jìn)行DNA提取處理,以提高支原體檢測的靈敏度:
1、細胞培養基中的血清濃度如果超過(guò)12%,那么對下游的PCR反應會(huì )產(chǎn)生抑制。酚紅,對熒光定量PCR的檢測也會(huì )干擾。這些均可以通過(guò)使用德國Miverva Biolabs公司的支原體DNA提取試劑盒來(lái)解決。
2、對于樣品類(lèi)型是細胞團、疫苗、凍存細胞和石蠟包埋的組織,需要提前提取DNA。
3、如果樣品中蛋白含量高于10mg/ml,則先需要用蛋白酶K進(jìn)行處理,再用原體DNA提取試劑盒提取樣品中的DNA。
德國Minerva Biolabs公司生產(chǎn)的Venor®GeM Sample preparation Kit支原體DNA提取試劑盒,可實(shí)現支原體檢測方法驗證過(guò)程中的樣品制備步驟,包括DNA提取和純化,可防止可能干擾qPCR擴增的污染物或抑制劑的引入。從細胞上清和生物制品中分離支原體DNA,全程只需30分鐘。該試劑盒的操作分四步:細胞溶解,DNA特異性與層析柱結合,祛除殘留的污染物和抑制劑,洗脫DNA。
該試劑盒符合歐洲藥典規范,配合支原體qPCR檢測試劑盒、支原體標準品一起使用,通過(guò)歐洲藥典的方法學(xué)驗證,助力新藥上市。